Deisenhausen liegt in der Region Donau-Iller, an dem Fluss Günz.
Deisenhausen liegt 3 km westlich der Kleinstadt Krumbach (Schwaben) und ziemlich in der Mitte zwischen Augsburg und Ulm. Im Süden sind die nächst größeren Städte Mindelheim und Memmingen und im Norden die Stadt Günzburg.
Es existieren folgende Gemarkungen: Deisenhausen, Oberbleichen, Unterbleichen.
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